2017年4月20日上午10:00,我校“理學(xué)之美”前沿論壇第七十六講在理化樓401順利舉行,清華大學(xué)陳挺教授作了題為“Reconstructing Cell Cycle Pseudo Time-Series via Single-cell Transcriptome Data”的學(xué)術(shù)報(bào)告。
報(bào)告中,陳挺教授主要從單細(xì)胞RNA測(cè)序的重要性、單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展前景以及分析處理單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的模型和算法等方面進(jìn)行了講解。他首先指出:細(xì)胞分裂的具體過程不能通過顯微鏡等手段直接觀察到,必須對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序以研究細(xì)胞內(nèi)部發(fā)生的變化,而隨著技術(shù)的發(fā)展,現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)必將不斷創(chuàng)新與突破,最終測(cè)序誤差和成本都將降到相對(duì)較低的水平,接著陳挺教授介紹了基于旅行商問題和隱馬爾可夫模型的一個(gè)用于統(tǒng)計(jì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的計(jì)算方法,并展示了使用該方法分析老鼠基因取得的成果。
報(bào)告結(jié)束,陳挺教授對(duì)老師、同學(xué)們提出的問題進(jìn)行了詳細(xì)解答,使大家對(duì)報(bào)告內(nèi)容有更深入的理解。
附:
陳挺教授現(xiàn)任職清華大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系、智能技術(shù)與系統(tǒng)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。
陳挺教授長(zhǎng)期研究大數(shù)據(jù)高效算法設(shè)計(jì)和機(jī)器學(xué)習(xí),并應(yīng)用于研究人類基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白組,高通量大數(shù)據(jù)分析,醫(yī)學(xué)信息分析。在生物調(diào)控系統(tǒng)的數(shù)學(xué)模型、蛋白質(zhì)組學(xué)以及質(zhì)譜儀數(shù)據(jù)處理、高通量測(cè)序數(shù)據(jù)處理、宏基因組數(shù)據(jù)處理和復(fù)雜疾病的遺傳學(xué)研究等方面均取得了一系列重要的研究成果。負(fù)責(zé)及參與美國(guó)自然科學(xué)基金會(huì)(NSF)、美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生研究院(NIH),中國(guó)自然科學(xué)基金(NSFC)等項(xiàng)目十余項(xiàng)。在Science、PNAS、Nature Communications, Cell systems,Genome Research、American Journal of Human Genetics等國(guó)際著名期刊發(fā)表學(xué)術(shù)論文95余篇,被引超過10000次(Google Scholar),其中19篇論文被引用超過100次。2004年獲得美國(guó)史隆基金會(huì)研究獎(jiǎng)(Sloan Fellow)。
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